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Bio-Speedy SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR

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Según las estadísticas extraídas de la base de datos GISAID entre noviembre y diciembre de 2021, el 97% de todas las variantes de SARS-CoV-2 con la mutación NSP6 LSG105-107del son Omicron, mientras que solo el 53% de todas las variantes de SARS-CoV-2 con la mutación S HV69-70del son Omicron.

La variante Omicron indica un posible aumento del escape inmunitario, la transmisibilidad y el riesgo de reinfección. Por lo tanto, en el cribado rutinario del SARS-CoV-2, además de la detección de todas las variantes, es crucial analizar y distinguir la mutación NSP6 LSG105-107del para la detección de la variante Omicron. Dado que la detección de variantes es importante para la epidemiología, se necesitan tecnologías distintas del análisis de secuencias de ADN para poder analizar un porcentaje mucho mayor de casos sospechosos en un tiempo mucho más breve.

Los kits de detección de variantes en regiones donde las variantes son prevalentes disminuirán la carga de detección de variantes con secuenciación de ADN. Además, al formar parte del cribado rutinario, los descensos en la prevalencia de la variante Omicron pueden detectarse rápidamente, y los estudios para identificar el tipo de variante que circula en el campo en lugar de la variante Omicron pueden iniciarse rápidamente.

Uso previsto:

El kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR es una prueba de PCR de transcripción
Inverso de un paso en tiempo real utilizado para la detección cualitativa y la distinción de los genes ORF1ab y N específicos de la variante de Omicron SARS-CoV-2.

Objetivo:

El kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR además de apuntar a las regiones del gen ORF1ab y N que son comunes a todos los SARS-CoV-2 , apunte a la mutación NSP6 LSG105-107del para la detección de variantes de Omicron. Los objetivos de SARS-COV-2 se leen en el canal FAM y la mutación NSP6 LSG105-107del que detecta la variante Omicron se lee en el canal Cy5 del instrumento Real Time PCR. El gen RNase P, que se dirige a un control interno, también se lee en el canal HEX.

Funcionamiento y duración:

El kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR, cuando se usa con el tubo de transferencia vNAT®, prepara la muestra para la PCR en tiempo real en 5 minutos y proporciona el resultado de Real Time PCR en menos de 30 minutos de protocolo.

Dispositivos validados y compatibles:

El kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR está validado para un volumen de reacción de 10 µl en el instrumento Bio-Rad CFX96 Touch™ Real Time Extensión PCR.

Workflow

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